Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX5Q9Y5X3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNX5Q9Y5X3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNX5Q9Y5X3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms