Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO3Q9Y5L0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNPO3Q9Y5L0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms