Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHB12Q9Y5F1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHB12Q9Y5F1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms