Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHB2Q9Y5E7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms