Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHB4Q9Y5E5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHB4Q9Y5E5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHB4Q9Y5E5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB4Q9Y5E5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms