Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAF6Q9Y4K3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms