Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED7Q9Y3B3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMED7Q9Y3B3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms