Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED5Q9Y3A6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMED5Q9Y3A6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMED5Q9Y3A6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms