Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M2

SSUH2, Protein SSUH2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSUH2Q9Y2M2 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSUH2Q9Y2M2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSUH2Q9Y2M2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSUH2Q9Y2M2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSUH2Q9Y2M2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSUH2Q9Y2M2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSUH2Q9Y2M2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms