Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSX2IPQ9Y2D8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX2IPQ9Y2D8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms