Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP1Q9UPQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AGAP1Q9UPQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AGAP1Q9UPQ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms