Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCAF8Q9UPN6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SCAF8Q9UPN6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SCAF8Q9UPN6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SCAF8Q9UPN6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms