Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP17Q9ULZ9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP17Q9ULZ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP17Q9ULZ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms