Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTC7AQ9ULT0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTC7AQ9ULT0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC7AQ9ULT0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC7AQ9ULT0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC7AQ9ULT0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC7AQ9ULT0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC7AQ9ULT0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms