Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRFN2Q9ULH4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LRFN2Q9ULH4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRFN2Q9ULH4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms