Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND2AQ9ULE3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DENND2AQ9ULE3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DENND2AQ9ULE3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms