Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNOT11Q9UKZ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT11Q9UKZ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms