Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH13Q9UKX3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MYH13Q9UKX3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MYH13Q9UKX3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms