Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO4Q9UKT5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXO4Q9UKT5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXO4Q9UKT5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms