Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTBP2Q9UKA9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTBP2Q9UKA9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTBP2Q9UKA9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTBP2Q9UKA9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTBP2Q9UKA9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms