Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GGA2Q9UJY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GGA2Q9UJY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms