Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDC23Q9UJX2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC23Q9UJX2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC23Q9UJX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC23Q9UJX2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDC23Q9UJX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDC23Q9UJX2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDC23Q9UJX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms