Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HACL1Q9UJ83 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HACL1Q9UJ83 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HACL1Q9UJ83 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms