Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAX2Q9UIW0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VAX2Q9UIW0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms