Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMPXQ9UHP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMPXQ9UHP9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms