Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EBF1Q9UH73 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EBF1Q9UH73 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EBF1Q9UH73 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms