Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms