Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCF20Q9UGU0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF20Q9UGU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms