Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
EIF3KQ9UBQ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIF3KQ9UBQ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIF3KQ9UBQ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms