Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPNE7Q9UBL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CPNE7Q9UBL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms