Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MTRRQ9UBK8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRRQ9UBK8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRRQ9UBK8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MTRRQ9UBK8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRRQ9UBK8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRRQ9UBK8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms