Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPARGC1AQ9UBK2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPARGC1AQ9UBK2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPARGC1AQ9UBK2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms