Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms