Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNIH4Q9P003 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNIH4Q9P003 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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