Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD2Q9NZR1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMOD2Q9NZR1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMOD2Q9NZR1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMOD2Q9NZR1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms