Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NLGN3Q9NZ94 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN3Q9NZ94 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN3Q9NZ94 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms