Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BARHL2Q9NY43 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BARHL2Q9NY43 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BARHL2Q9NY43 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms