Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM260Q9NX78 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM260Q9NX78 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM260Q9NX78 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms