Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PARVAQ9NVD7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARVAQ9NVD7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARVAQ9NVD7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms