Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AP5S1Q9NUS5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AP5S1Q9NUS5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms