Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABCF3Q9NUQ8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCF3Q9NUQ8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms