Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ECHDC1Q9NTX5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECHDC1Q9NTX5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECHDC1Q9NTX5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms