Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC6A13Q9NSD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC6A13Q9NSD5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms