Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER3Q9NSC5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOMER3Q9NSC5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOMER3Q9NSC5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms