Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT82Q9NSB4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT82Q9NSB4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT82Q9NSB4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms