Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NDUFA4L2Q9NRX3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFA4L2Q9NRX3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms