Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SNRKQ9NRH2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNRKQ9NRH2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNRKQ9NRH2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms