Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC3Q9NQT5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC3Q9NQT5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms