Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A4GALTQ9NPC4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A4GALTQ9NPC4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A4GALTQ9NPC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms