Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB18Q9NP72 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB18Q9NP72 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB18Q9NP72 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms